Inizio anni '90, lo Stato viene posto sotto assedio. La nuova legge prevede il carcere duro, il sequestro dei beni e l'attenuazione della pena per i collaboratori. Questa normativa non piace alla Cupola che, in una tormentata riunione dei capimafia, decide la linea dura. Da quel momento in poi si scatena una guerra allo Stato, senza esclusioni di colpi. Cosa Nostra sta per vincere, usa la corruzione e la complicità di politici, poliziotti e magistrati amici. Si apre una trattativa segreta fra Stato e Mafia, ma quando questa pone le proprie condizioni, esse appaiono inaccettabili ma, oramai, lo Stato è reso inerme e battuto. Solo pochi uomini e donne rimangono sul campo a combattere una guerra che appare perduta. Fanno parte di una squadra d'élite, vengono chiamati Lupi perché si muovono in simbiosi, seguono le tracce come belve assetate di sangue, fino a colpire la preda quando nemmeno se lo aspetta. Sono Lupi, e come tali vengono considerati un branco; un unico e affiatato branco. Questa è la storia particolare di uno di loro, il commissario Matteo Alfonsi e quella di altri uomini e donne straordinari. È la storia della squadra antimafia e dei... Lupi di Palermo.